（1）糞便常規（RT）及隱血（或稱潛血、OB）試驗。用竹簽挑取少許新鮮糞便（約蠶豆大小），應選擇其中有膿血、粘液的部分或顏色異常部分。如無異常，則可自糞便表面不同部位及糞便深處多部位取材，放入干燥清潔有蓋的蠟紙盒或塑料盒內立即送檢，不能超過2小時。
注意事項：
①使用新鮮標本，采集后立即送檢。標本久置可因 pH 及消化酶等因素而使糞便中細胞成分分解破壞。
②標本中不可混有尿液，更不可從尿壺或便盆中采取糞便標本，因為尿液可使糞中柔弱的原蟲致死。
③糞便標本中也不可混入植物、泥土、污水等，因腐生性原蟲、真菌孢子、植物種子、花粉易混淆實驗結果。
④無糞便而又必須檢查時可經肛門指診獲取糞便。灌腸后的糞便常因過稀及混有油滴等而不適于作檢查標本。
⑤糞便標本不應用衛生紙包裹，應直接裝入蠟紙盒或塑料盒，以防水分丟失細胞被破壞。
（2）糞便寄生蟲檢查標本。
①檢查寄生蟲卵標本留取方法及注意事項同便常規檢查。
②檢查阿米巴滋養體應于排便后從膿血性或稀軟部分取材，立即（2小時內）送檢。患者在家中留取標本時，送檢過程中應采取保溫措施，因為阿米巴原蟲可在低溫下失去活動力從而不宜查到。
③檢查蟯蟲卵時，在清晨排便前自肛門四周皺襞處拭取標本，盡快（2小時內）送檢。
（3）糞便培養標本準備無菌便盒。采集新鮮糞便標本的過程應盡量無菌操作。
①直腸拭子法：用無菌拭子蘸生理鹽水濕潤，由肛門插入約 6～7cm，輕輕在直腸內旋動取出大便少許，放入無菌便盒中，加蓋封口送檢。
②自然排便法：病人在清潔便盆內排便，用竹簽挑取大便中膿血或粘液部分（約栗子大小，2～3g；液體糞便取絮狀物 2～3ml），放入無菌便盒中送檢。
注意：所挑取的大便不應接觸其它部位，如便盆。注意盡可能在使用抗生素使用之前收集糞便，糞便標本中不可混入尿液及其它異物。
